פיתח מספר ניתוחים במקטע הקדמי והאחורי של העין וכן שיטות דיאגנוסטיות חדשניות. שלושה פיתוחים שלי מוסחרו לחברות ולפני שנתיים זכה בפרס שטיין על הצטיינות ברפואת עיניים.
מ2017, ראש הוועדה לאתיקה בארגון חקר העין העולמי וחבר בוועדת הפטנטים של תל השומר.
רפרנט של משרד הבריאות עבור מחקרים קליניים בארץ. השתתף בוועדות של משרד הבריאות לאישור תרופות.
יזם ומנהל רפואי ראשי של 2 חברות חממה, יועץ רפואי ומדעי לחברת המכשור הרפואי אקיוטום בארה"ב (חברת בת של חברת הענק הלמה).
מעבדת המחקר של דר' רוטנשטרייך היא מהגדולות כיום בארץ בתחום חקר העין, כוללת חוקרים, פוסט דוקטורנטים וסטודנטים לתואר שני ושלישי מהפקולטות לרפואה ולהנדסה ביו רפואית, סטודנטים לרפואה במסגרת פרוייקט חץ ותוכנית ניו-יורק ואנשי ביולוגיה חישובית. המחקרים אותם יזם ומוביל הינם מחקרים ישומיים ומחקרים קליניים שמטרתם לפתח כלי אבחון וטיפולים חדשים למחלות ניווניות בעיניים ובמח.
מרכז חוג באוניברסיטה, מרצה בכיר בפקולטה לרפואה בחוג עיניים וחבר בבית הספר סגול למדעי המח של אוניברסיטת תל אביב.